RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF205	O95201	554 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TSPAN15	O95858	294 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RAC2	P15153	192 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	P2RY10	O00398	339 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PHYH	O14832	338 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A1W2PPL8	197 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864		J3QW42	95 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	GPR137B	O60478	399 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	LIPF	P07098	398 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	HTR5A	P47898	357 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SGCE	O43556	437 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	DOK2	O60496	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CFHR2	P36980	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	IER3	P46695	156 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ERF	P50548	548 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864		A6NIZ1	184 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	C22orf46	C9J442	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	TOX4	O94842	621 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SCG5	P05408	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SFTPB	P07988	381 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	PSMB10	P40306	273 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	NPY4R	P50391	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC18A1	P54219	525 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	RAP1B	P61224	184 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	RAP1A	P62834	184 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TNNI3-208	ENST00000589864	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23

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