RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.05■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 WDFY2Q96P53 400 aa20.05■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.05■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-207ENST00000589146 SLC22A24Q8N4F4 322 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-207ENST00000589146 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-207ENST00000589146 PBOV1Q9GZY1 135 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF587BE7ETH6 402 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ADRB1P08588 477 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CD40LGP29965 261 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 THBS2P35442 1172 aa19.99■□□□□ 0.79
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