RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP4O75096 1905 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FITM1A5D6W6 292 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRA5A6NI73 299 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR32B1ATL7 298 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AGRPO00253 132 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MFNGO00587 321 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 JTBO76095 146 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PLATP00750 562 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ABOP16442 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PTNP21246 168 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FPR2P25090 351 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MST1P26927 711 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 IL12BP29460 328 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CAV2P51636 162 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 F2RL1P55085 397 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC26A5P58743 744 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MESP2Q0VG99 397 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SMCO1Q147U7 214 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf27AQ580R0 203 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OPN5Q6U736 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 Q7L0L9 218 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NAA40Q86UY6 237 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HOGA1Q86XE5 327 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LYPD6Q86Y78 171 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C3Q8NH37 302 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TERB2Q8NHR7 220 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 POM121Q96HA1 1249 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM8Q96KF7 97 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA7Q96KW9 195 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5B2Q96R09 309 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NRTNQ99748 197 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CMKLR1Q99788 373 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB33BQ9H082 229 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP11Q9NR21 331 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM131Q92545 1883 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01553A4QN01 128 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf51A6NDU8 294 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 IDSB3KWA1 339 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS8O00214 317 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC31A1O15431 190 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EFSO43281 561 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HCRTR1O43613 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPB7O75200 414 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SFT2D2O95562 160 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CST4P01036 141 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SPARCP09486 303 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXB2P14652 356 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DRD1P21728 446 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GRPRP30550 384 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MEOX2P50222 304 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CCR4P51679 360 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EFNB2P52799 333 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC37A1P57057 533 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GUCA2AQ02747 115 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EGR4Q05215 589 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R1AQ13522 171 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PEA15Q15121 130 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF529Q6P280 563 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 BMPERQ8N8U9 685 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LFNGQ8NES3 379 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.93□□□□□ -1.3
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