RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 RDH5Q92781 318 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LRGUKQ96M69 825 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IFT27Q9BW83 186 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SYT4Q9H2B2 425 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 EMC7Q9NPA0 242 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 POLE4Q9NR33 117 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DECR2Q9NUI1 292 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DNHD1Q96M86 4753 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 A0A096LNT2 108 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PLSCR5A0PG75 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 VWC2LB2RUY7 222 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF11BO00300 401 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SGCEO43556 437 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LMX1BO60663 402 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RENP00797 406 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TGFAP01135 160 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HPXP02790 462 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SEMG1P04279 462 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF250P15622 560 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CTLA4P16410 223 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 COL8A2P25067 703 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CRABP1P29762 137 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HTR5AP47898 357 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OTPQ5XKR4 325 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LEG1Q6P5S2 330 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FAM122BQ7Z309 247 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SYT9Q86SS6 491 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ADCK1Q86TW2 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FANK1Q8TC84 345 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf45Q96LM5 186 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD8Q96LT4 415 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GPA33Q99795 319 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 WACQ9BTA9 647 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 BEX2Q9BXY8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NUAK2Q9H093 628 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR52D1Q9H346 318 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CHODLQ9H9P2 273 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RTTNQ86VV8 2226 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf100A8MU93 164 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 H3BSA7 217 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IMPA2O14732 288 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SPRY3O43610 288 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DOK2O60496 412 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDC14BO60729 498 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCNB2O95067 398 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MPZL1O95297 269 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD16AO95870 558 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA2P01563 188 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DQA2P01906 255 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SCG5P05408 212 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1B2P21281 511 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FPR3P25089 353 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GIFP27352 417 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 WNT5AP41221 380 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB1P43366 347 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF81P51508 661 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1CBP62140 327 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCL8P80075 99 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TEKQ02763 1124 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN31Q12999 210 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TMED1Q13445 227 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 AQP6Q13520 282 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms