RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIGD4Q8IY51 512 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1F12Q8NHA8 337 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM118AQ9NWS6 357 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMPPBQ9Y5P6 360 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYSRT1A8MQ03 144 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAF1P04049 648 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCSK6P29122 969 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 KEAP1Q14145 624 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN1P1Q5VSP4 162 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 GID4Q8IVV7 300 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6N2Q8NGY6 317 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF442Q9H7R0 627 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A6O15403 523 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRP9O43818 475 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 DANCRP0C864 163 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSKH1P11801 424 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH24Q86UP0 819 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP6Q96JE9 813 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ7Q99807 217 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCXQ9H320 206 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZD2O15018 2839 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC182A6NF36 153 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A31A6NKX4 558 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTKP33981 857 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHFQ7M4L6 423 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPY19L4Q7Z388 723 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCXRQ7Z4W1 244 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 NINJ1Q92982 152 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSMD1Q96PZ7 3565 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP6P51161 128 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM154Q6P9G4 183 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 VHLLQ6RSH7 139 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL14Q8N1E6 418 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF555Q8NEP9 628 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL19Q99731 98 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICMTO60725 284 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATE1O95260 518 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLRXP35754 106 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD52P43351 418 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCP2P55851 309 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS23P62266 143 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ECH1Q13011 328 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPK1Q13546 671 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC15Q8N387 334 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATF6BQ99941 703 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2L14Q9BZR8 327 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMP3Q9UQV4 416 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENOFO60613 162 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOD3P08294 240 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM157BP0CG42 384 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD53P19397 219 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 THBS4P35443 961 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGTLC2Q14390 218 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGAP6Q5VW22 663 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DTX2Q86UW9 622 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2FQ969M7 185 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSTM5A8MXK1 200 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNASE1P24855 282 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT5AP41221 380 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADIPOQQ15848 244 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A30Q5SVS4 291 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL9Q6T311 187 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10S1Q8NGN2 331 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST7LQ8TDW4 575 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM171Q8WVE6 324 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFBPL1Q8WX77 278 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A6Q92536 515 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGTQ969N2 578 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPRIN2O60269 458 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF101Q8IZC7 436 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTOSQ8NHW6 89 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFKQ969G6 155 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf45Q96LM5 186 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAO2Q9NYQ3 351 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPZL2O60487 215 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMPD2O60906 423 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD16AO95870 558 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A9Q7RTY1 509 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLAMF6Q96DU3 332 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51B6Q9H340 312 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL3Q9HB03 270 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBLN4Q9NTU7 201 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMAHPQ9Y471 501 aa28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms