RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569192.5

BBS2-219, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-219	ENST00000569192		E7ESA3	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192		H0YIV9	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192		K7ERQ8	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ZW10	O43264	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MFN2	O95140	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TRBC1	P01850	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	OPN1LW	P04000	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CD55	P08174	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PHB	P35232	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	GNPDA1	P46926	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CXCL12	P48061	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	BDH1	Q02338	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	KDSR	Q06136	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF154	Q13106	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CIB1	Q99828	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CUBN	O60494	3623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	AGRN	O00468	2067 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	HDAC3	O15379	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	RIPK2	O43353	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	LAT	O43561	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	AGT	P01019	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	IL1B	P01584	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CSF2	P04141	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ALOX5	P09917	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	HPGD	P15428	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TEAD1	P28347	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	DLST	P36957	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MAGEA3	P43357	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	MAX	P61244	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	NAB1	Q13506	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CST6	Q15828	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192		Q3ZCU0	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	OMD	Q99983	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-219	ENST00000569192	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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