RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCB11	O95342	1321 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WW49	117 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0B4J2E0	115 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GX12	115 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PLD3	99 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		G3V2L1	256 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		G3V3Y1	287 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SMKR1	H3BMG3	65 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EQG2	157 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SULT1C2	O00338	296 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC17A2	O00624	439 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNGR1	O43759	233 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SCRG1	O75711	98 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RCBTB2	O95199	551 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFAIP8	O95379	198 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV1-44	P01699	117 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DRA	P01903	254 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HPN	P05981	417 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CD3G	P09693	182 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf88	P0DMB2	117 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CD1D	P15813	335 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB5A	P20339	215 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNE1	P24864	410 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCR2	P25025	360 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PDHA2	P29803	388 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR1F	P30939	366 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GNRHR	P30968	328 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HRH1	P35367	487 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA3	P43357	314 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DS4	P43632	304 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA13	P48723	471 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GPM6A	P51674	278 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RAP1GDS1	P52306	607 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LIM2	P55344	173 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AP3S2	P59780	193 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GNB1	P62873	340 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPX	P78539	464 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL7	P80098	99 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GLO1	Q04760	184 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ST3GAL4	Q11206	333 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A6	Q13433	755 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TFDP2	Q14188	446 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FLOT2	Q14254	428 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MTF1	Q14872	753 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LPAL2	Q16609	132 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SMUG1	Q53HV7	270 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD6	Q53TS8	623 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DRAM2	Q6UX65	266 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZT83	130 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DAW1	Q8N136	415 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2L5	Q8NG80	312 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL9	Q8TC94	416 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK4	Q8TEW6	326 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RASL10A	Q92737	203 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RCN3	Q96D15	328 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALT6	Q96L58	329 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF681	Q96N22	645 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3GL3	Q99963	347 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TM2D1	Q9BX74	207 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PARL	Q9H300	379 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		2.22	□□□□□ -2.05

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