RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 ZAR1LA6NP61 321 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TRIM77I1YAP6 450 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 HMGN1P05114 100 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TACSTD2P09758 323 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DAOP14920 347 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 SLC16A7O60669 478 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 ADRA2CP18825 462 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 CDAP32320 146 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RAD23AP54725 363 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 CRMP1Q14194 572 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SIAEQ9HAT2 523 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-231ENST00000552222 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 BMP4P12644 408 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 ZNF3P17036 446 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 NPR2P20594 1047 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 GIFP27352 417 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 PEX2P28328 305 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SERPINF1P36955 418 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SLC25A1P53007 311 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 ADIPOQQ15848 244 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 LPCAT4Q643R3 524 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 C12orf73Q69YU5 71 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SKA3Q8IX90 412 aa11.83□□□□□ -0.52
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CS-231ENST00000552222 SH3GL3Q99963 347 aa11.83□□□□□ -0.52
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CS-231ENST00000552222 FN3KQ9H479 309 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 RERGLQ9H628 205 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 C8orf4Q9NR00 106 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PPL8 197 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 FARS2O95363 451 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 ATP6V1G2O95670 118 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 HLA-HP01893 362 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-231ENST00000552222 SCG5P05408 212 aa11.82□□□□□ -0.52
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