RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 PRSS12P56730 875 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RPL27P61353 136 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PCBD1P61457 104 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ASPHD2Q6ICH7 369 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OR2T2Q6IF00 324 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PCGF1Q9BSM1 259 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ALG12Q9BV10 488 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MMP27Q9H306 513 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 POLE4Q9NR33 117 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 F5H5P2 479 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 SURF4O15260 269 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ICMTO60725 284 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TSPAN15O95858 294 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 SFTPBP07988 381 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 DBHP09172 617 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TSPAN19P0C672 248 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 IFI30P13284 250 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PMELP40967 661 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 Q6YL49 198 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 FITM2Q8N6M3 262 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NPEPL1Q8NDH3 523 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OR51A7Q8NH64 312 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 HAVCR1Q96D42 359 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TBCCD1Q9NVR7 557 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MIOXQ9UGB7 285 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MED31Q9Y3C7 131 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 C12orf71A8MTZ7 269 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MELTFP08582 738 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RBM34P42696 430 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PITPNBP48739 271 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 GUCY1A3Q02108 690 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NFYCQ13952 458 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OR8B3Q8NGG8 313 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PTP4A1Q93096 173 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OR8B2Q96RD0 313 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RERGLQ9H628 205 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 WDR76Q9H967 626 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 HIF3AQ9Y2N7 669 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RNF114Q9Y508 228 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUS0 222 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 GMNCA6NCL1 334 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 C22orf46C9J442 243 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TIMM23O14925 209 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ANGPT2O15123 496 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 MLNRO43193 412 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 SGCEO43556 437 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OR5F1O95221 314 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 HLA-DPB1P04440 258 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NR2C1P13056 603 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 GZMMP51124 257 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 SLC18A1P54219 525 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 OCLNQ16625 522 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 VMACQ2NL98 169 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TTMPQ5BVD1 217 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 GPR157Q5UAW9 335 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 LRRC75AQ8NAA5 344 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 LIPHQ8WWY8 451 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 C7orf26Q96N11 449 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 RHCGQ9UBD6 479 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 CLN8Q9UBY8 286 aa13.41□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 FBP2O00757 339 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 IMPA2O14732 288 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ZNF404Q494X3 552 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 CROCCP2Q86T23 111 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 TLCD1Q96CP7 247 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 BPIFA2Q96DR5 249 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-227ENST00000551441 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 NDUFA7O95182 113 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 IGHV4-59P01825 116 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 COX5BP10606 129 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms