RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547216.1

ARHGAP9-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, human

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 587 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF254	O75437	659 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SULT1C4	O75897	302 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CLPTM1	O96005	669 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PTH	P01270	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	APOC1	P02654	83 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SCG5	P05408	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	H2BFM	P0C1H6	154 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF32	P17041	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AGA	P20933	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ETV1	P50549	477 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WNT4	P56705	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MED22	Q15528	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SGCD	Q92629	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RORB	Q92753	470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATF6B	Q99941	703 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	METTL15	A6NJ78	407 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216		J3QLW9	94 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RER1	O15258	196 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HLA-H	P01893	362 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HTR1A	P08908	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PPP3CB	P16298	524 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF19	P17023	458 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	UGT2B10	P36537	528 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HTR5A	P47898	357 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HCCS	P53701	268 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TAS2R43	P59537	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ROM1	Q03395	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF85	Q03923	595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NEDD8	Q15843	81 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CDON	Q4KMG0	1287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	S100PBP	Q96BU1	408 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PSMB9	P28065	219 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	APLNR	P35414	380 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAP2K4	P45985	399 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RAB1A	P62820	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IRF3	Q14653	427 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPHAR	Q15513	63 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms