RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL16	Q8N461	479 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2L2	Q8NH16	312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP50	Q9UKX7	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KNL1	Q8NG31	2342 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NIZ1	184 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX46	H3BTG2	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GOSR2	O14653	212 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	AKR7A2	O43488	359 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CHMP2A	O43633	222 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TBL1X	O60907	577 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV2-5	P01817	119 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	THY1	P04216	161 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCR2	P25025	360 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNA8	P32881	189 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CCR2	P41597	374 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	MEOX2	P50222	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GPM6A	P51674	278 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RAP1B	P61224	184 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KYAT1	Q16773	422 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR151	Q8TDV0	419 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OTUB2	Q96DC9	234 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CPB2	Q96IY4	423 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ITCH	Q96J02	903 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	HES2	Q9Y543	173 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308		V9GY05	133 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GTQ1	180 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB29	O14966	203 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	YKT6	O15498	198 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF1	P05230	155 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA5	P08758	320 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF24	P17028	368 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	NTS	P30990	170 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL2	P36404	184 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	NSG1	P42857	185 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RGR	P47804	291 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OR3A4P	P47883	348 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB9A	P51151	201 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXW4	P57775	412 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SPAG1	Q07617	926 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	C15orf32	Q32M92	178 aa		3	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93

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