RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-222ENST00000533557 HERPUD1Q15011 391 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 LAPTM4AQ15012 233 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 OR2T2Q6IF00 324 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 REEP3Q6NUK4 255 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ZER1Q7Z7L7 766 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FGFRL1Q8N441 504 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SGCDQ92629 289 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PPP1R14AQ96A00 147 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PHF21AQ96BD5 680 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TRIM15Q9C019 465 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TMCC3Q9ULS5 477 aa10□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 CENPBD1B2RD01 187 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SURF4O15260 269 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 OPN1SWP03999 348 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TSPAN19P0C672 248 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 UMPSP11172 480 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 GSTM3P21266 225 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ARF6P62330 175 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FADDQ13158 208 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MAB21L1Q13394 359 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MAVSQ7Z434 540 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PFN4Q8NHR9 129 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PTP4A1Q93096 173 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 EMC7Q9NPA0 242 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 A0A1W2PRG6 482 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MCIDASD6RGH6 385 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MPIG6BO95866 241 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 HLA-DPB1P04440 258 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 HIST1H2ABP04908 130 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 DBHP09172 617 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 EFNB2P52799 333 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SCARB2Q14108 478 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MPPED2Q15777 294 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 OR8G5Q8NG78 346 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 OR52B2Q96RD2 323 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 RMND5AQ9H871 391 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 INIPQ9NRY2 104 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 VAPAQ9P0L0 249 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TENM2Q9NT68 2774 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 A0A1B0GWJ7 208 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 IFNL4K9M1U5 179 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 BIRC5O15392 142 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 IDO1P14902 403 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 RAC2P15153 192 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 CD47Q08722 323 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 STX3Q13277 289 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 Q6ZTK2 550 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 KRT73Q86Y46 540 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PTOV1Q86YD1 416 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PNKDQ8N490 385 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 TECTBQ96PL2 329 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 MMP28Q9H239 520 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PPA2Q9H2U2 334 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.97□□□□□ -0.81
BBS1-222ENST00000533557 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms