RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522962.5

STAU2-222, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene STAU2, Length 1,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-222	ENST00000522962	TMEM163	Q8TC26	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	RNF128	Q8TEB7	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TM9SF4	Q92544	642 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	RAB1C	Q92928	201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	NEIL2	Q969S2	332 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	IGSF21	Q96ID5	467 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	CEP19	Q96LK0	163 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TECTB	Q96PL2	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	DUX5	Q96PT3	197 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	BBS2	Q9BXC9	721 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	KLHL31	Q9H511	634 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ABCB9	Q9NP78	766 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SATB2	Q9UPW6	733 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ASB4	Q9Y574	426 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	COL4A2	P08572	1712 aa		5.08	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PCM1	Q15154	2024 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LTBP2	Q14767	1821 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962		A0A1W2PP11	408 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	IRGM	A1A4Y4	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	WWP2	O00308	870 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PRKY	O43930	277 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZIC3	O60481	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	CDRT1	O95170	752 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	EPPIN	O95925	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PRKAR1A	P10644	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ACP2	P11117	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LAP3	P28838	519 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	BDKRB1	P46663	353 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TGM4	P49221	684 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PDX1	P52945	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	WNT4	P56705	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SMIM11A	P58511	58 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	BTG1	P62324	171 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	TBPL1	P62380	186 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SP3	Q02447	781 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	DMPK	Q09013	629 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	RAB40B	Q12829	278 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SLA	Q13239	276 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	DMC1	Q14565	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SYPL1	Q16563	259 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	DDI2	Q5TDH0	399 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	SLC34A3	Q8N130	599 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	LINC00471	Q8N535	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	NATD1	Q8N6N6	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STAU2-222	ENST00000522962	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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