RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	AIG1	Q9NVV5	245 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A0G2JPF8	293 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PPH5	198 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM23	O14925	209 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2T1	O43869	369 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT33A	O76009	404 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	AKR7A3	O95154	331 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	AHSA1	O95433	338 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXB5	P09067	269 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TFPT	P0C1Z6	253 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4A8	P0C604	315 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CECR9	P0C854	216 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NR2F1	P10589	423 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ETFA	P13804	333 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	IDO1	P14902	403 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ARR3	P36575	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC1A6	P48664	564 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	EVX1	P49640	407 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	VSNL1	P62760	191 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NAAA	Q02083	359 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SCGB2A2	Q13296	93 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CEACAM7	Q14002	265 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	GGTLC2	Q14390	218 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR7A5	Q15622	319 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	LIPN	Q5VXI9	398 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM225	Q6GV28	225 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM99	Q8N816	258 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXO17	Q96EF6	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TXNDC15	Q96J42	360 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52E6	Q96RD3	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB18	Q99592	522 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SELENON	Q9NZV5	590 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	IFT52	Q9Y366	437 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	RFXANK	O14593	260 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	AIM2	O14862	343 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	HDAC3	O15379	428 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TCF21	O43680	179 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINI2	O75830	405 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	LY6H	O94772	140 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF432	O94892	652 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	LGI1	O95970	557 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	PNMT	P11086	282 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	DAO	P14920	347 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CBR1	P16152	277 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	CCNA2	P20248	432 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NPR2	P20594	1047 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	FADD	Q13158	208 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	MAPK11	Q15759	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT71	Q3SY84	523 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	REP15	Q6BDI9	236 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SHF	Q7M4L6	423 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	NOXA1	Q86UR1	476 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX32	Q86XE0	403 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF786	Q8N393	782 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR6S1	Q8NH40	331 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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