RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513433.1

SNX25-206, Transcript of sorting nexin 25, human

TSL 3

Gene SNX25, Length 748 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX25-206	ENST00000513433	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433		A0A087WUU8	490 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	CCL21	O00585	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TOX	O94900	526 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	DIRAS1	O95057	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	VAMP5	O95183	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RCBTB2	O95199	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	GADD45G	O95257	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SYNGR4	O95473	234 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TGM6	O95932	706 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	CST1	P01037	141 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OPN1LW	P04000	364 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	CCNA2	P20248	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	AGA	P20933	346 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PTN	P21246	168 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	AGTR1	P30556	359 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	DCTD	P32321	178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OMP	P47874	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	SLC9A3	P48764	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	NUP107	P57740	925 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PRKCD	Q05655	676 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	PUDP	Q08623	228 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR7A5	Q15622	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	HSPB2	Q16082	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	RND1	Q92730	232 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	OSTF1	Q92882	214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNX25-206	ENST00000513433	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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