RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB2Q8N680 514 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR1P1Q8NH06 330 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR51F2Q8NH61 342 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 STYXQ8WUJ0 223 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MOAP1Q96BY2 351 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 C12orf42Q96LP6 360 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF607Q96SK3 696 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 KATNBL1Q9H079 304 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MPZL2O60487 215 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 CSO75390 466 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PDX1P52945 283 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NAAAQ02083 359 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NFATC4Q14934 902 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 34.9
PDE4D-216ENST00000507116 PLK5Q496M5 336 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FAHD1Q6P587 224 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 AMER3Q8N944 861 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR2T29Q8NH02 315 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FRZBQ92765 325 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SNX22Q96L94 193 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR6C1Q96RD1 312 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MICU1Q9BPX6 476 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 GPR35Q9HC97 309 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OSER1Q9NX31 292 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TBX21Q9UL17 535 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MEMO1Q9Y316 297 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RNF222A6NCQ9 220 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 F8WDY8 70 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 GPR75O95800 540 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ESDP10768 282 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 AMD1P17707 334 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 GPX2P18283 190 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MMP11P24347 488 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HOXC9P31274 260 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SNCAP37840 140 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MTNR1AP48039 350 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 H2BFSP57053 126 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RAB30Q15771 203 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 AMZ1Q400G9 498 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 XKR7Q5GH72 579 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RGMBQ6NW40 437 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 WDR82Q6UXN9 313 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 BATF2Q8N1L9 274 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR2T12Q8NG77 320 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 THEM6Q8WUY1 208 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FIZ1Q96SL8 496 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TBX5Q99593 518 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 NELFAQ9H3P2 528 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 ALG9Q9H6U8 611 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC37A3O60309 1634 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RAD51DO75771 328 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 SERPIND1P05546 499 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM225BP0DP42 221 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 FUT1P19526 365 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TLE3Q04726 772 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 RING1Q06587 406 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TTLL4Q14679 1199 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 TEAD2Q15562 447 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 MST1LQ2TV78 715 aa5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PDE4D-216ENST00000507116 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms