RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TBX15Q96SF7 602 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS8O00214 317 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-DOBP13765 273 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CAPZA2P47755 286 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PITPNBP48739 271 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 EFNB2P52799 333 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 GNB2P62879 340 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZR03 302 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 POLE4Q9NR33 117 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 DUSP13Q9UII6 198 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PIN1P1O15428 100 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TIPRLO75663 272 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC6A1P30531 599 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 ATG16L1Q676U5 607 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CALHM1Q8IU99 346 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 TEX37Q96LM6 180 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.4□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GVI7 797 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF32P17041 273 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 ITM2AO43736 263 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 C7orf26Q96N11 449 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 ADORA3P0DMS8 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 NOS3P29474 1203 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.39□□□□□ -1.39
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PDE4D-210ENST00000503258 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-210ENST00000503258 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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