RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 COL8A2P25067 703 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PYCR1P32322 319 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MAGEB1P43366 347 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TEKQ02763 1124 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF786Q8N393 782 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A10Q8NG04 563 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 OR1F12Q8NHA8 337 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GIPC3Q8TF64 312 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SNX33Q8WV41 574 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 DDOQ99489 341 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 FEVQ99581 238 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 C17orf100A8MU93 164 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 FKBP6O75344 327 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HLA-DQA2P01906 255 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GSTM3P21266 225 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GCH1P30793 250 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CBX1P83916 185 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PPP2R2BQ00005 443 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 LNX2Q8N448 690 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 IQCF1Q8N6M8 205 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GJC3Q8NFK1 279 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ELOVL3Q9HB03 270 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GPR160Q9UJ42 338 aa10.26□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ATRQ13535 2644 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CUBNO60494 3623 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 LRP5LA4QPB2 252 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TVP23AA6NH52 213 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ICMTO60725 284 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CDC14BO60729 498 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 E2F6O75461 281 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GYPBP06028 91 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PRKACGP22612 351 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GIFP27352 417 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 GGT2P36268 569 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ARHGDIAP52565 204 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HIST1H3AP68431 136 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CCL8P80075 99 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 COX10Q12887 443 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 RIN1Q13671 783 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CRMP1Q14194 572 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TRIP10Q15642 601 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLC36A3Q495N2 470 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ARL9Q6T311 187 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PROKR2Q8NFJ6 384 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 OR2T33Q8NG76 320 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 YIPF5Q969M3 257 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 STARD10Q9Y365 291 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 H3BN98 237 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 SPRY3O43610 288 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 LILRA1O75019 489 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 CLUP10909 449 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF823P16415 610 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF23P17027 643 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 POU1F1P28069 291 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 IL2RGP31785 369 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 ZNF81P51508 661 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 MMP15P51511 669 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-214ENST00000490425 PSG7Q13046 419 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms