RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 YIPF5Q969M3 257 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 OR2M2Q96R28 347 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 MMP28Q9H239 520 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 STMN3Q9NZ72 180 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 RCE1Q9Y256 329 aa5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HDLBP-243ENST00000488923 SCN2AQ99250 2005 aa5.9□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1B0GVI7 797 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1W2PPL8 197 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 LNP1A1A4G5 178 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 C7orf66A4D0T2 115 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 FAM172BPA6NC97 362 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 C4orf47A7E2U8 309 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 C17orf51A8MQB3 221 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 XRCC3O43542 346 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 EFNA2O43921 213 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 SSX4O60224 188 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 RBBP9O75884 186 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 TCRBP04435 133 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CSF1P09603 554 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CCL3P10147 92 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 RAB6AP20340 208 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 IL11P20809 199 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CTSSP25774 331 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 OTX2P32243 289 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 GDNFP39905 211 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CSNK1A1P48729 337 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 P2RY4P51582 365 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 FOXL2P58012 376 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ACTBP60709 375 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ACTG1P63261 375 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 GABREP78334 506 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 H3F3AP84243 136 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 MAB21L1Q13394 359 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 TAF13Q15543 124 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ETFDHQ16134 617 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 HIST3H3Q16695 136 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 C10orf128Q5T292 105 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 LUZP2Q86TE4 346 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 GPAT4Q86UL3 456 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 KDM8Q8N371 416 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CT55Q8WUE5 264 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 ASB5Q8WWX0 329 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 C10orf35Q96D05 121 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 RNF31Q96EP0 1072 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 AMELYQ99218 206 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 NEK6Q9HC98 313 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 CENPMQ9NSP4 180 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 MED29Q9NX70 200 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-243ENST00000488923 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.89□□□□□ -1.47
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