RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NUDT13Q86X67 352 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZNF675Q8TD23 568 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZNF75AQ96N20 296 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 OR4F4Q96R69 305 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 RBBP8Q99708 897 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CAPS2Q9BXY5 557 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 CENPHQ9H3R5 247 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.47□□□□□ -1.85
CNN3-206ENST00000487539 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GJE1A6NN92 205 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 H0YHG0 523 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 UPK1AO00322 258 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 BANF1O75531 89 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TGDSO95455 350 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LHBP01229 141 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 HLA-HP01893 362 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 WNT2P09544 360 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCDC175P0C221 793 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PAX6P26367 422 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GLRXP35754 106 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GLIPR1P48060 266 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 DLX1P56177 255 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 BASP1P80723 227 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TGFBR3Q03167 851 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ZMYND11Q15326 602 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 HFEQ30201 348 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCNJQ5T5M9 372 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GPR157Q5UAW9 335 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 REP15Q6BDI9 236 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 COMTD1Q86VU5 262 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TIMD4Q96H15 378 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ITCHQ96J02 903 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR51B6Q9H340 312 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 EMC3Q9P0I2 261 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 NPTNQ9Y639 398 aa3.46□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 J3KRW8 73 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 GPR171O14626 319 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PLOD3O60568 738 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PSMG1O95456 288 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 NUDT14O95848 222 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LY6G6CO95867 125 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 IGHV1-46P01743 117 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 HIST1H2ABP04908 130 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 PATE4P0C8F1 98 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 ACP2P11117 423 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MMP9P14780 707 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TMEM11P17152 192 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CCNA2P20248 432 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 TGFBR2P37173 567 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 KIR2DS4P43632 304 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 MAPK12P53778 367 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RWDD2BP57060 319 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 OR2B6P58173 313 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SLC35A2P78381 396 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 H3F3AP84243 136 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 COX10Q12887 443 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SELENBP1Q13228 472 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 CUL3Q13618 768 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SLC17A1Q14916 467 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 QPRTQ15274 297 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 RASA2Q15283 850 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 LY6EQ16553 131 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
CNN3-206ENST00000487539 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms