RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLATP00750 562 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 VMACQ2NL98 169 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RABL3Q5HYI8 236 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 CCDC80Q76M96 950 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR5AS1Q8N127 324 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR10A6Q8NH74 314 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM239Q8WW34 195 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 UPRTQ96BW1 309 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PKP2Q99959 881 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MARCH7Q9H992 704 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 GID8Q9NWU2 228 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 IL19Q9UHD0 177 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 STARD10Q9Y365 291 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.11□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ICMTO60725 284 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 THRBP10828 461 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 COX4I1P13073 169 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 TNFRSF1BP20333 461 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 KITLGP21583 273 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MSR1P21757 451 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 HTR5AP47898 357 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MMP16P51512 607 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PAX2Q02962 417 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OCLNQ16625 522 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ALG10Q5BKT4 473 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 KLBQ86Z14 1044 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 UBE2FQ969M7 185 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ALG12Q9BV10 488 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM165Q9HC07 324 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 EMC7Q9NPA0 242 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MIOXQ9UGB7 285 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RIMS3Q9UJD0 308 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MED31Q9Y3C7 131 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 SRRM5B3KS81 715 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 TIMM23O14925 209 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PIP5K1CO60331 668 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 DOK2O60496 412 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ERFP50548 548 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 CRYBA2P53672 197 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 GYS2P54840 703 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 CTXN1P60606 82 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 GNGT1P63211 74 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 FNDC8Q8TC99 324 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 PTP4A1Q93096 173 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 RCN3Q96D15 328 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 HAVCR1Q96D42 359 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF583Q96ND8 569 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR8B2Q96RD0 313 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 ECSITQ9BQ95 431 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 MMP27Q9H306 513 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 GCM1Q9NP62 436 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 C1RLQ9NZP8 487 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 IFNL4K9M1U5 179 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 SGCEO43556 437 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 SCG5P05408 212 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 TSPAN19P0C672 248 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 COX5BP10606 129 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 IFI30P13284 250 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 TUBG1P23258 451 aa11.08□□□□□ -0.64
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRDX6P30041 224 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms