RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.49□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GPR160Q9UJ42 338 aa6.49□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.49□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 A6NHS1 94 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 B2RBV5 119 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 J3QW42 95 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 XKRYO14609 159 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CDC42EP2O14613 210 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 ARPC3O15145 178 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 IDH3BO43837 385 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PTP4A3O75365 173 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SERPINI2O75830 405 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SEC14L2O76054 403 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GADD45GO95257 159 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 F13BP05160 661 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CST2P09228 141 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 COX5BP10606 129 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 NCK1P16333 377 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TUBG1P23258 451 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GCH1P30793 250 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CAPZA2P47755 286 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 RPS6KA3P51812 740 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CTXN1P60606 82 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GALK2Q01415 458 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MVKQ03426 396 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PIGFQ07326 219 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MIDNQ504T8 468 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 FGD3Q5JSP0 725 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 NABP1Q96AH0 204 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CITED4Q96RK1 184 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP13Q9UII6 198 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 NUP50Q9UKX7 468 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 RYR3Q15413 4870 aa6.48□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PPW3 197 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PRSS37A4D1T9 235 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 AQP12BA6NM10 295 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CLDN25C9JDP6 229 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CLPTM1O96005 669 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-13P01766 116 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 ADH4P08319 380 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 T-ENOLP0DO92 83 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GPR4P46093 362 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GIPRP48546 466 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 GSSP48637 474 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SELENOVP59797 346 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CCL8P80075 99 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SPIBQ01892 262 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 PLP2Q04941 152 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 CD47Q08722 323 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN31Q12999 210 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 RAB39AQ14964 217 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 MOGQ16653 247 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 AVPI1Q5T686 147 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 DHFR2Q86XF0 187 aa6.47□□□□□ -1.37
RBBP4-211ENST00000477563 SKA3Q8IX90 412 aa6.47□□□□□ -1.37
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