RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 FCRLAQ7L513 359 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SYT9Q86SS6 491 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 RAB22AQ9UL26 194 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF150Q9ULK6 438 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 FAAHO00519 579 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 MT-CO2P00403 227 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM225BP0DP42 221 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IL9P15248 144 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFSF4P23510 183 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP11P24347 488 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP2F1P24903 491 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 CST5P28325 142 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ARL3P36405 182 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR3A2P47893 321 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 NPY4RP50391 375 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ST8SIA6P61647 398 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP2CBP62714 309 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP2CAP67775 309 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 BTG2P78543 158 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IL13RA1P78552 427 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 DOC2BQ14184 412 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ELOBQ15370 118 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 BTNL8Q6UX41 500 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM129CQ86XR2 697 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 LAS2Q8IYD9 372 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC16Q8NEE8 873 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 DCAF4Q8WV16 495 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ASB5Q8WWX0 329 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf36Q96KX1 117 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 DPY30Q9C005 99 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 NELFAQ9H3P2 528 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PARP14Q460N5 1801 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 MYADML2A6NDP7 307 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PROB1E7EW31 1015 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 K7EPK0 472 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 LDB2O43679 373 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 OR7C2O60412 319 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNGR4O95473 234 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 IGSF6O95976 241 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP1B1P05026 303 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 ATF1P18846 271 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TACR2P21452 398 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMB4P28070 264 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SOX18P35713 384 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 LGALS7P47929 136 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 TFPI2P48307 235 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SPIBQ01892 262 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 BDH1Q02338 343 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 BCL2L1Q07817 233 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SURF1Q15526 300 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-208ENST00000471759 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms