RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MEP1BQ16820 701 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OTPQ5XKR4 325 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR1F12Q8NHA8 337 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CDADC1Q9BWV3 514 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ARMC1Q9NVT9 282 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNG2Q9UJ96 466 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6C6A6NF89 314 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 RER1O15258 196 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CIB2O75838 187 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3-13P01766 116 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF823P16415 610 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF3P17036 446 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TUBG1P23258 451 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA46Q5T0L3 261 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM154Q6P9G4 183 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 Q71RC1 249 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC37A3Q8NCC5 494 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A40Q8TBP6 338 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 UBASH3BQ8TF42 649 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 NRBF2Q96F24 287 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 COG8Q96MW5 612 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2J1Q9GZK6 312 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 LHFPL6Q9Y693 200 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TIPRLO75663 272 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TFP02787 698 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 NAT2P11245 290 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 PYCR1P32322 319 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 GRK5P34947 590 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 RGS6P49758 472 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H3AP68431 136 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CRMP1Q14194 572 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKBH6Q3KRA9 238 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ELFN2Q5R3F8 820 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST2H3AQ71DI3 136 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF786Q8N393 782 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ATG16L2Q8NAA4 619 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC9Q8WXX5 260 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 DDOQ99489 341 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 COQ7Q99807 217 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CMC2Q9NRP2 79 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.394e-10■■■■□ 20.9
SH3BP1-205ENST00000466097 PLSCR5A0PG75 271 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 C17orf100A8MU93 164 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 J3QW42 95 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 NGFP01138 241 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 OSMP13725 252 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 POU1F1P28069 291 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 FMO3P31513 532 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPAP38571 399 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 NR4A2P43354 598 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 BLVRAP53004 296 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A1P53007 311 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ECH1Q13011 328 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMAT1Q5H9K5 638 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC18B1Q6NT16 456 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CORO6Q6QEF8 472 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00346Q8IVM7 164 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 PITX2Q99697 317 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX12Q9BXU0 123 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms