RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 APH1BQ8WW43 257 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DACH2Q96NX9 599 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CLN6Q9NWW5 311 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCA4P78363 2273 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DPRXA6NFQ7 191 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RER1O15258 196 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MPZL2O60487 215 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 APOL3O95236 402 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB36O95755 333 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HRGP04196 525 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ROS1P08922 2347 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYGSP22914 178 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR1FP30939 366 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ARR3P36575 388 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX19P40855 299 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA13P48723 471 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ENTPD1P49961 510 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 BLVRAP53004 296 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ISL1P61371 349 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PCBD1P61457 104 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IL18R1Q13478 541 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AQP6Q13520 282 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF774Q6NX45 483 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SHFQ7M4L6 423 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TIGD4Q8IY51 512 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF75AQ96N20 296 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 INTS14Q96SY0 518 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MARCH7Q9H992 704 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 AMBNQ9NP70 447 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PTPN13Q12923 2485 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SGCEO43556 437 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CECR9P0C854 216 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL2P13500 99 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SPOCK1Q08629 439 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX30Q5JUR7 227 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATC1Q76KD6 591 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 THEM6Q8WUY1 208 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RFKQ969G6 155 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RNFT2Q96EX2 444 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP6Q96JE9 813 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CNBD2Q96M20 576 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 Q96MT0 163 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TBX5Q99593 518 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB26Q9ULW5 256 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 COPS3Q9UNS2 423 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 U3KQE9 123 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 PLCE1Q9P212 2302 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 DOK2O60496 412 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 TMCC2O75069 709 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms