RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 TNFRSF1AP19438 455 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 SLC6A6P31641 620 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 RGS6P49758 472 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 MXRA7P84157 204 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 C16orf89Q6UX73 402 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 FANK1Q8TC84 345 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 NUAK2Q9H093 628 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0G2JMP0 313 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0X1KG70 313 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 OR6C6A6NF89 314 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 IMPA2O14732 288 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 OR10H3O60404 316 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 DCTN3O75935 186 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 TXNDC12O95881 172 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 RENP00797 406 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 SCG5P05408 212 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 FABP3P05413 133 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 CD55P08174 381 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 NOS3P29474 1203 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 MNAT1P51948 309 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 PSG7Q13046 419 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 SEC23BQ15437 767 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 SPATS1Q496A3 300 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 GJC3Q8NFK1 279 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 PTP4A1Q93096 173 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 MSL2Q9HCI7 577 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 FBN3Q75N90 2809 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 A0A0A6YYJ9 748 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 KCNMB1Q16558 191 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 RFX4Q33E94 735 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 ST7LQ8TDW4 575 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 CMBLQ96DG6 245 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 CDRT15Q96T59 188 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 IFT27Q9BW83 186 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 CACNG2Q9Y698 323 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC78-204ENST00000439619 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 J3QLI3 93 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 UBOX5O94941 541 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R3DO95685 299 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 IGHV2-5P01817 119 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 KITLGP21583 273 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 GATA3P23771 443 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 FPR3P25089 353 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 GNGT1P63211 74 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 CDK5R2Q13319 367 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 SLC36A3Q495N2 470 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 LEG1Q6P5S2 330 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 HAVCR1Q96D42 359 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 OR52D1Q9H346 318 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 STARD10Q9Y365 291 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 ARPC2O15144 300 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 ARPC3O15145 178 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 PLPP2O43688 288 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 IDH3BO43837 385 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 KRT36O76013 467 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 RAC2P15153 192 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 SAMD8Q96LT4 415 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 FUZQ9BT04 418 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 IL19Q9UHD0 177 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 NPTNQ9Y639 398 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 RER1O15258 196 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 SEMG1P04279 462 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 RRM2P31350 389 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 FXYD6P3P58550 94 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM255AQ5JRV8 349 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC78-204ENST00000439619 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms