RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-209ENST00000439106 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
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PRAME-209ENST00000439106 B4DSR2 109 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 CLDN25C9JDP6 229 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 CCNB2O95067 398 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 SOX14O95416 240 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 GASTP01350 101 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DQA2P01906 255 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 PSKH1P11801 424 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 HNF1AP20823 631 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-209ENST00000439106 GSTM3P21266 225 aa11.73□□□□□ -0.53
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