RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SEC22AQ96IW7 307 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CBX7O95931 251 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TET1Q8NFU7 2136 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 POM121CA8CG34 1229 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LILRB5O75023 590 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 STK17BO94768 372 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PPP3CBP16298 524 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 S100A2P29034 98 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC25A1P53007 311 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CCL7P80098 99 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 BTN1A1Q13410 526 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LILRB2Q8N423 598 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 A0A087WZY1 265 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TNFSF14O43557 240 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR1L3Q8NH93 324 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 HINT2Q9BX68 163 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 R4GMQ9 66 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CD300LBA8K4G0 201 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 F8W036 122 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CT62P0C5K7 136 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 IL32P24001 234 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 IL2RGP31785 369 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1CAP62136 330 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 FOXF1Q12946 379 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 INSL4Q14641 139 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF141Q15928 474 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 NAXDQ8IW45 347 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 APH1AQ96BI3 265 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ATF6BQ99941 703 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ABHD6Q9BV23 337 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 JAM3Q9BX67 310 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 HRO43593 1189 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 EPHA1P21709 976 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 MUCL1Q96DR8 90 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 IKZF1Q13422 519 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SMCO3A2RU48 225 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ALG1L2C9J202 215 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 FFAR1O14842 300 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 FOLR1P15328 257 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TNFSF4P23510 183 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ACSM1Q08AH1 577 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LRFN1Q9P244 771 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PQF6 199 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 STMND1H3BQB6 276 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 M0R135 149 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 BEX5Q5H9J7 111 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TOR2AQ5JU69 321 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF799Q96GE5 643 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR8B4Q96RC9 309 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PLA2G10O15496 165 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PLPP2O43688 288 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 GPR137BO60478 399 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SEMG1P04279 462 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ABOP16442 354 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LYPD8Q6UX82 237 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 UPRTQ96BW1 309 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 PELI1Q96FA3 418 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms