RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CPT2P23786 658 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 CD1CP29017 333 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 DUSP2Q05923 314 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 LAT2Q9GZY6 243 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 FAM60AQ9NP50 221 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.16■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 CPED1A4D0V7 1026 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ARGFXA6NJG6 315 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF883P0CG24 379 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 RNF44Q7L0R7 432 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TMED6Q8WW62 240 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 IDSB3KWA1 339 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF208O43345 1280 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 RAB3DO95716 219 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 WNT11O96014 354 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 PNLIPP16233 465 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 SSR2P43308 183 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TAS2R19P59542 299 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ACTBP60709 375 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ACTG1P63261 375 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 HGFACQ04756 655 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 Q499Y3 187 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 BEND4Q6ZU67 534 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35A4Q96G79 324 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TGM7Q96PF1 710 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.15■□□□□ 0.02
CNGA3-205ENST00000436404 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 LYPD3O95274 346 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC34A2O95436 690 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PGAM2P15259 253 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR1Q1Q15612 314 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 EIPR1Q53HC9 387 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM205Q6UW68 189 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TAAR9Q96RI9 348 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 HRH4Q9H3N8 390 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TUBA4BQ9H853 241 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MED31Q9Y3C7 131 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 P2RX6O15547 441 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 LY86O95711 162 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MC3RP41968 323 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT16Q8N428 558 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 GPX8Q8TED1 209 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.14■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1B0GV90 55 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CD2P06729 351 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A6P31641 620 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 RAB5CP51148 216 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SSX9Q7RTT3 188 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TLCD2A6NGC4 264 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MFNGO00587 321 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 DUX1O43812 170 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CD5P06127 495 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CTSBP07858 339 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 LAP3P28838 519 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 EFNB2P52799 333 aa15.13■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms