RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MOKQ9UQ07 419 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 A0A075B6Q4 140 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JN53 185 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FUOMA2VDF0 154 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C76A6NM76 312 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF11BO00300 401 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH7O60245 1069 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LDB3O75112 727 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ICOSLGO75144 302 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SYNGR4O95473 234 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF682O95780 498 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ADAP00813 363 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CRYBA1P05813 215 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MSMBP08118 114 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRKACGP22612 351 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CBLP22681 906 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OMGP23515 440 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PTAFRP25105 342 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 AHRP35869 848 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC15A1P46059 708 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 BCAP31P51572 246 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN15P56746 228 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CDK6Q00534 326 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRKCDQ05655 676 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 BIKQ13323 160 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 AQP6Q13520 282 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GNA13Q14344 377 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TAF9Q16594 264 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 REEP3Q6NUK4 255 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf87Q6PH81 154 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TTLQ8NG68 377 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PMM1Q92871 262 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NEIL2Q969S2 332 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MOAP1Q96BY2 351 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PPCDCQ96CD2 204 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ITPAQ9BY32 194 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FKRPQ9H9S5 495 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ACER3Q9NUN7 267 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 VNN3Q9NY84 501 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ANGPT4Q9Y264 503 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PRB8 838 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IRGMA1A4Y4 181 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PTGES3LE9PB15 166 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf84H3BNL1 204 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GUCY1B2O75343 617 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINB7O75635 380 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MT-ND1P03886 318 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MT-ND5P03915 603 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TFPTP0C1Z6 253 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OCM2P0CE71 109 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DAOP14920 347 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IL7RP16871 459 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GIFP27352 417 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRIM2P49643 509 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CDC42P60953 191 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 HBA1P69905 142 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EFNB1P98172 346 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PLIN5Q00G26 463 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms