RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TBX21Q9UL17 535 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa2.05□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF726A6NNF4 738 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 DFNA5O60443 496 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 KRT14P02533 472 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 ALDOBP05062 364 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CSF3P09919 207 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NSG1P42857 185 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CDH6P55285 790 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF92Q03936 586 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 FZD2Q14332 565 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SGCAQ16586 387 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CNIH2Q6PI25 160 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CERS6Q6ZMG9 384 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 H2AFVQ71UI9 128 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 OFCC1Q8IZS5 231 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 MS4A15Q8N5U1 240 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 FAM210BQ96KR6 192 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 C6orf50Q9HD87 102 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 PXMP2Q9NR77 195 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 PSME2Q9UL46 239 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NFASCO94856 1347 aa2.04□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 COL4A1P02462 1669 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TRAV39A0A0B4J263 110 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 C9JVG2 144 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 M0QZ92 97 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NMT2O60551 498 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJB6O75190 326 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 MGMTP16455 207 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 FOXN2P32314 431 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SLC26A3P40879 764 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SSR4P51571 173 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 AQP6Q13520 282 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SHHQ15465 462 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 RFX4Q33E94 735 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 LCN12Q6JVE5 192 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM220Q6QAJ8 160 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 C19orf35Q6ZS72 473 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZSR3 168 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 OR1S2Q8NGQ3 325 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 ACMSDQ8TDX5 336 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 PEX13Q92968 403 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM54Q969K7 222 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC58Q96CX6 371 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 SMIM10Q96HG1 83 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 CHP1Q99653 195 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 RARRES2Q99969 163 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 NRBP2Q9NSY0 501 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 DLG5Q8TDM6 1919 aa2.03□□□□□ -2.08
CCDC82-202ENST00000423339 A0A0B4J2A0 478 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GVI7 797 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 SMCO2A6NFE2 343 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 RSPH10B2B2RC85 870 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 CASC3O15234 703 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 CDH16O75309 829 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 RSPH10BP0C881 870 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 OR1G1P47890 313 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 CCR8P51685 355 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 RPS15P62841 145 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 UNC119Q13432 240 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.03□□□□□ -2.09
CCDC82-202ENST00000423339 OTUD6AQ7L8S5 288 aa2.03□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms