RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416108.5

RBM39-208, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ST7L	Q8TDW4	575 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	UFD1	Q92890	307 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SPTSSA	Q969W0	71 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	FBXO17	Q96EF6	278 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CCDC120	Q96HB5	630 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ATF6B	Q99941	703 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR6C6	A6NF89	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	C16orf97	H3BN30	126 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RER1	O15258	196 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HLA-H	P01893	362 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PATE4	P0C8F1	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSKH1	P11801	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	APLNR	P35414	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SLC6A9	P48067	706 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TPTE	P56180	551 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR12D2	P58182	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RAB1A	P62820	205 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TUBA1B	P68363	451 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ROM1	Q03395	351 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TSC22D1	Q15714	1073 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ZNF774	Q6NX45	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TUBA1A	Q71U36	451 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SSX8	Q7RTT4	187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR5M11	Q96RB7	305 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	AMELY	Q99218	206 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MGLL	Q99685	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	COQ7	Q99807	217 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SP140L	Q9H930	580 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LRP12	Q9Y561	859 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OR5H1	A6NKK0	313 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108		F5H5K5	113 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	INMT	O95050	263 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	ADRA2A	P08913	450 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	COX5B	P10606	129 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PCMT1	P22061	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	DCTD	P32321	178 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TTK	P33981	857 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSMB10	P40306	273 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	OPRL1	P41146	370 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CX3CR1	P49238	355 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PRKX	P51817	358 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	HIST1H3A	P68431	136 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	PSG4	Q00888	419 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	GALK2	Q01415	458 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	BDH1	Q02338	343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	BLMH	Q13867	455 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM39-208	ENST00000416108	CCDC58	Q4VC31	144 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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