RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 MTFR2Q6P444 385 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FDX2Q6P4F2 183 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00696Q6ZRV3 163 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT74Q7RTS7 529 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB43Q86YS6 212 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB124Q8NES8 71 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6X1Q8NH79 312 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM41AQ96HV5 264 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNJ15Q99712 375 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DEPPQ9NTK1 212 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PINLYPA6NC86 204 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STMND1H3BQB6 276 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LYRM1O43325 122 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 AQP8O94778 261 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAF1P04049 648 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HRGP04196 525 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD3GP09693 182 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAR1AP10644 381 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SRD5A2P31213 254 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD96P40200 585 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKXP51817 358 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 H3F3AP84243 136 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RIN1Q13671 783 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SGCAQ16586 387 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF10Q5QP82 559 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RFT1Q96AA3 541 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NTNG2Q96CW9 530 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SFXN2Q96NB2 322 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf198Q9H425 327 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NLKQ9UBE8 527 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DHDHQ9UQ10 334 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 R4GMQ9 66 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RTTNQ86VV8 2226 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 P2RY10O00398 339 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD2P06729 351 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK1A1P48729 337 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CARD18P57730 90 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF13Q15543 124 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TGIF1Q15583 401 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PCK2Q16822 640 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STPG1Q5TH74 334 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PLET1Q6UQ28 207 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LUZP2Q86TE4 346 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB5Q8WWX0 329 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HES7Q9BYE0 225 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GLTPQ9NZD2 209 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HHLA2Q9UM44 414 aa3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms