RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 PTOV1Q86YD1 416 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 PTP4A1Q93096 173 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM15Q9C019 465 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 PHYHO14832 338 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 FSTL3O95633 263 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV1-69P01742 117 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 SCG5P05408 212 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TUBG1P23258 451 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 PCBD1P61457 104 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 LAPTM4AQ15012 233 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 LHX4Q969G2 390 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 MPP4Q96JB8 637 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 WDFY2Q96P53 400 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 OR52B2Q96RD2 323 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 VAPAQ9P0L0 249 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN9O75954 239 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 OR7A10O76100 309 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 COX5BP10606 129 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GUCY1A3Q02108 690 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PFN4Q8NHR9 129 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPL8 197 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 UBDO15205 165 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 MLNRO43193 412 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN19P0C672 248 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GPX2P18283 190 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 FUT4P22083 530 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PSMB10P40306 273 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 HTR5AP47898 357 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T2Q6IF00 324 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 MAVSQ7Z434 540 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SYT9Q86SS6 491 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 OR8G5Q8NG78 346 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A6Q92536 515 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TECTBQ96PL2 329 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 RBP7Q96R05 134 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SIRPDQ9H106 197 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 CTSZQ9UBR2 303 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GMNCA6NCL1 334 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC30A6NM36 301 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 F5H5P2 479 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 M0QX08 132 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GPR37O15354 613 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 MT-ND1P03886 318 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 RAC2P15153 192 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 OR13G1Q8NGZ3 307 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ALG12Q9BV10 488 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 EMC7Q9NPA0 242 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GMEB1Q9Y692 573 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DOK2O60496 412 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 LIPFP07098 398 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NR2C1P13056 603 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 MSR1P21757 451 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms