RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391014.1

RNU6-1228P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1228, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1228P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DEGS2Q6QHC5 323 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KDM8Q8N371 416 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR11H7Q8NGC8 314 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR2G2Q8NGZ5 317 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 HSFY1Q96LI6 401 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPR82Q96P67 336 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ATP6V0BQ99437 205 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OMDQ99983 421 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GGTLC1Q9BX51 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FBXO8Q9NRD0 319 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SSH2Q76I76 1423 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MUC21A0A140T8X8 626 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MYBPHLA2RUH7 354 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF860A6NHJ4 632 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPR89AB7ZAQ6 455 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SLC31A1O15431 190 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GATBO75879 557 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPR89BP0CG08 455 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MPIP34949 423 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAGEA6P43360 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ERFP50548 548 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 P2RX1P51575 399 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SYNJ2BPP57105 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ST3GAL4Q11206 333 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KLRB1Q12918 225 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RCAN2Q14206 197 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DMC1Q14565 340 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DGUOKQ16854 277 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PYHIN1Q6K0P9 492 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 STEAP2Q8NFT2 490 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C4orf36Q96KX1 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TTC25Q96NG3 672 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SH3GL1Q99961 368 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KRT23Q9C075 422 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DSN1Q9H410 356 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 INIPQ9NRY2 104 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PLXNA3P51805 1871 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GBF1Q92538 1859 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SOX15O60248 233 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MFN2O95140 757 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CTSLP07711 333 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CD3GP09693 182 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DNAJB1P25685 340 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SSR1P43307 286 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 PRMT2P55345 433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TWF1Q12792 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC80Q76M96 950 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF563Q8TA94 476 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OSTF1Q92882 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR8B4Q96RC9 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 GPA33Q99795 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 FAM206AQ9NX38 181 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 IL19Q9UHD0 177 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MAST4O15021 2626 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 A0A1B0GVL5 298 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 C9JVG2 144 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CLDN3O15551 220 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RAMP3O60896 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 DIRAS1O95057 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 AIFM1O95831 613 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 RPN2P04844 631 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CD28P10747 220 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CDKN2DP55273 166 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 SPC24Q8NBT2 197 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1228P-201ENST00000391014 OR10R2Q8NGX6 335 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms