RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ST6GAL1P15907 406 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL7P80098 99 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK5Q00535 292 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB30Q15771 203 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 COX11Q9Y6N1 276 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 M0R082 166 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 COL4A6Q14031 1691 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A25A4D2G3 310 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ISM1B1AKI9 464 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 XRCC2O43543 280 aa6.12□□□□□ -1.43
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