RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 DMRTA2Q96SC8 542 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF649Q9BS31 505 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HDHD2Q9H0R4 259 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CHD6Q8TD26 2715 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 WNT11O96014 354 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CD36P16671 472 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CPEP16870 476 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CELP19835 753 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 COX5AP20674 150 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PSMB10P40306 273 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ECH1Q13011 328 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GSG1Q2KHT4 349 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC58Q4VC31 144 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LIPNQ5VXI9 398 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ASB5Q8WWX0 329 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PELI1Q96FA3 418 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OPALINQ96PE5 141 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 AMELYQ99218 206 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR2H1Q9GZK4 316 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ATMQ13315 3056 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 DPPA5A6NC42 116 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OR6C6A6NF89 314 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 B8ZZF3 427 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-HP01893 362 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PATE4P0C8F1 98 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CHRNB4P30926 498 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 DCTDP32321 178 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OPRL1P41146 370 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HTR5AP47898 357 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SLC6A9P48067 706 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TGM4P49221 684 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CX3CR1P49238 355 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RGS6P49758 472 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 RAB1AP62820 205 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H3AP68431 136 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GALK2Q01415 458 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SLC3A1Q07837 685 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GPR50Q13585 617 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TRAM1Q15629 374 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GABRA6Q16445 453 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GPR107Q5VW38 600 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LIPKQ5VXJ0 399 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ARL9Q6T311 187 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 AKR7LQ8NHP1 331 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ15Q99712 375 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 COQ7Q99807 217 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 SP140LQ9H930 580 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 BRD7Q9NPI1 651 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 FBXL3Q9UKT7 428 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 R4GMQ9 66 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 A8MXE2 369 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 F5H5K5 113 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GNLYP22749 145 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PAX7P23759 505 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 APLNRP35414 380 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 LIPAP38571 399 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PRKXP51817 358 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TPTEP56180 551 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 PSG4Q00888 419 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TPBGQ13641 420 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-201ENST00000368202 TSC22D1Q15714 1073 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms