RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 MED20Q9H944 212 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 USE1Q9NZ43 259 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.61□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 TVP23AA6NH52 213 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ZAR1LA6NP61 321 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 VSTM5A8MXK1 200 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 EI24O14681 340 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 COX5BP10606 129 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CLUP10909 449 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 BLVRAP53004 296 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 GJC3Q8NFK1 279 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.6□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 C5orf49A4QMS7 147 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 RER1O15258 196 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CD8AP01732 235 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ALPLP05186 524 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CCNOP22674 350 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 EPHA2P29317 976 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 THBS4P35443 961 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 HTR5AP47898 357 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 ALDH3A2P51648 485 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 RAD23AP54725 363 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 RAB35Q15286 201 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CORO6Q6QEF8 472 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CPOQ8IVL8 374 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 CBR4Q8N4T8 237 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 PTP4A1Q93096 173 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 PERPQ96FX8 193 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.59□□□□□ -0.07
SFTPC-201ENST00000318561 GLCEO94923 617 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 OR4A8P0C604 315 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 GLRXP35754 106 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 GGT2P36268 569 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 SERPINF1P36955 418 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ENTPD1P49961 510 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 HIST1H3AP68431 136 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ADIPOQQ15848 244 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 C12orf73Q69YU5 71 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF511Q8NB15 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 CMAHPQ9Y471 501 aa14.58□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 OR6C6A6NF89 314 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 OVOL3O00110 214 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 PRODHO43272 600 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 SYNGR3O43761 229 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 PRKYO43930 277 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 GPRIN2O60269 458 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 FAM157BP0CG42 384 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 RAD52P43351 418 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 UCP2P55851 309 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 RCN1Q15293 331 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 KLHL12Q53G59 568 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.57□□□□□ -0.08
SFTPC-201ENST00000318561 EME1Q96AY2 570 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms