RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 NUS1Q96E22 293 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM68Q96MH6 324 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TUBA4BQ9H853 241 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 CA14Q9ULX7 337 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 F10P00742 488 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 HLA-DQA2P01906 255 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 G0S2P27469 103 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 HTR2CP28335 458 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PMELP40967 661 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 RAP1AP62834 184 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 NTHL1P78549 312 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 RAB32Q13637 225 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MEF2DQ14814 521 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 GUK1Q16774 197 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MIDNQ504T8 468 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FJX1Q86VR8 437 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 AVL9Q8NBF6 648 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FAM46BQ96A09 425 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 UCK1Q9HA47 277 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1W2PRU2 124 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM212A6NML5 194 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF726A6NNF4 738 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF727A8MUV8 499 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FAM157AC9JC47 383 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TXNDC12O95881 172 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 IL2RAP01589 272 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SFTPBP07988 381 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FABP4P15090 132 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FLT3LGP49771 235 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SCAND1P57086 179 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PKIAP61925 76 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 FKBP1BP68106 108 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SPOCK1Q08629 439 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 WDR38Q5JTN6 314 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TPGS2Q68CL5 300 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM215Q68D42 235 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 AWAT2Q6E213 333 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MR1Q95460 341 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MCHR2Q969V1 340 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 INTS14Q96SY0 518 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 NMES1Q9C002 83 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 WDR76Q9H967 626 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PLXNA2O75051 1894 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 TGM5O43548 720 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 LDB3O75112 727 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 F13BP05160 661 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 NR2C1P13056 603 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRN3-201ENST00000308478 CTNNB1P35222 781 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms