RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637053.1

VIM-210, Transcript of vimentin, human

TSL 2

Gene VIM, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIM-210	ENST00000637053	TCL1A	P56279	114 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TMPRSS3	P57727	454 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RAB25	P57735	213 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC7A9	P82251	487 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PLA2G7	Q13093	441 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TEAD2	Q15562	447 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	OR1Q1	Q15612	314 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PSMD5	Q16401	504 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CALCRL	Q16602	461 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PLK5	Q496M5	336 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZNF585B	Q52M93	769 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	LCN10	Q6JVE6	187 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TMEM205	Q6UW68	189 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053		Q6ZT83	130 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RAB43	Q86YS6	212 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SKA3	Q8IX90	412 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CADM2	Q8N3J6	435 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	EMC1	Q8N766	993 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TMEM99	Q8N816	258 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ITFG1	Q8TB96	612 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	MAPK15	Q8TD08	544 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CCDC107	Q8WV48	283 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZNF488	Q96MN9	340 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	DOK1	Q99704	481 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	MED18	Q9BUE0	208 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	AMBN	Q9NP70	447 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	STARD5	Q9NSY2	213 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	IL17C	Q9P0M4	197 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RNF181	Q9P0P0	153 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RNF7	Q9UBF6	113 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PRODH2	Q9UF12	536 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	NEU3	Q9UQ49	428 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	OR1A2	Q9Y585	309 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	MST1R	Q04912	1400 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	NCOA1	Q15788	1441 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CEP162	Q5TB80	1403 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	CCDC160	A6NGH7	325 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	C5orf58	C9J3I9	102 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053		E7ENX8	843 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053		F5H6K3	240 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	SH2D1B	O14796	132 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
VIM-210	ENST00000637053	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99

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