RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SIAEQ9HAT2 523 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 LRP12Q9Y561 859 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 GALP22466 123 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 TEX19Q8NA77 164 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-215ENST00000628018 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS35Q8N3Z0 413 aa21.86■■□□□ 1.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 SH3GL3Q99963 347 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 MALT1Q9UDY8 824 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC9Q9Y3B6 208 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF3C1Q12789 2109 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-215ENST00000628018 FIGNL2A6NMB9 653 aa21.85■■□□□ 1.09
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