RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX8	P57073	446 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	EXT1	Q16394	746 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	C3AR1	Q16581	482 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf34	Q96MH7	638 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OR51B6	Q9H340	312 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	BCO1	Q9HAY6	547 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	NANS	Q9NR45	359 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	RASL12	Q9NYN1	266 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	BSN	Q9UPA5	3926 aa		6.52	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MXE2	369 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT19	A8MXV4	375 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MPZL2	O60487	215 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA7A	O75326	666 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	AGR2	O95994	175 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	PRPS2	P11908	318 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ABO	P16442	354 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MST1	P26927	711 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR6	P51684	374 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MXD1	Q05195	221 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	GAB1	Q13480	694 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM205	Q6UW68	189 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MOB3C	Q70IA8	216 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CMIP	Q8IY22	773 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	BEST4	Q8NFU0	473 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OR56B4	Q8NH76	319 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	PRORY	Q9H606	182 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	MYNN	Q9NPC7	610 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	VAPA	Q9P0L0	249 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGB1BP1	O14713	200 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	FZD7	O75084	574 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OPN1SW	P03999	348 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495		P04436	131 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	CD2	P06729	351 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ETFA	P13804	333 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR2A	P28223	471 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A2	P29034	98 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ADH7	P40394	386 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SELENOP	P49908	381 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC37A1	P57057	533 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	SKP2	Q13309	424 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8G1	Q15617	311 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF766	Q5HY98	468 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	RNLS	Q5VYX0	342 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF721	Q8TF20	911 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	AMBN	Q9NP70	447 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		6.51	□□□□□ -1.37
LETMD1-238	ENST00000623495	DKK4	Q9UBT3	224 aa		6.51	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms