RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 IGHV3-13P01766 116 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 CCNOP22674 350 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 ALDH3B1P43353 468 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 PPP2R2BQ00005 443 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC3-214ENST00000601319 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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HERC3-214ENST00000601319 NMNAT3Q96T66 252 aa14.72□□□□□ -0.05
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HERC3-214ENST00000601319 NOS3P29474 1203 aa14.71□□□□□ -0.05
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HERC3-214ENST00000601319 LNX2Q8N448 690 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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