RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 H0YJX3 145 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RER1O15258 196 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CRYAAP02489 173 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 COX5BP10606 129 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PSKH1P11801 424 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GABRB1P18505 474 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CADP27708 2225 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CALCRP30988 508 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FBN2P35556 2912 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ENTPD1P49961 510 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 KRTAP10-9P60411 292 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ADAM8P78325 824 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SPOCK1Q08629 439 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF774Q6NX45 483 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CORO6Q6QEF8 472 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 VCXQ9H320 206 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 C1orf198Q9H425 327 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.3■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SGCEO43556 437 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMCC2O75069 709 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 STOMP27105 288 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OCLNQ16625 522 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TTC23Q5W5X9 447 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SLC22A25Q6T423 547 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 INTS14Q96SY0 518 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR6C6A6NF89 314 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 H0YAE9 185 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SYNGR3O43761 229 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MPZL2O60487 215 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HGFACQ04756 655 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMED1Q13445 227 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GGTLC2Q14390 218 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GID4Q8IVV7 300 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NEUROG1Q92886 237 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MAP6Q96JE9 813 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ADI1Q9BV57 179 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 DOK2O60496 412 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SPARCP09486 303 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CCL2P13500 99 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NR4A1P22736 598 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HTR1FP30939 366 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 APLNRP35414 380 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CAPGP40121 348 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RAB35Q15286 201 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF691Q5VV52 312 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SHFQ7M4L6 423 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NUP37Q8NFH4 326 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CYGBQ8WWM9 190 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TFAP2CQ92754 450 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 APOL4Q9BPW4 351 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 VCX3BQ9H321 246 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms