RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM107Q6UX40 140 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZSR6 202 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD13Q7L211 337 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OOSP2Q86WS3 158 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STX19Q8N4C7 294 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NRACQ8N912 160 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10G6Q8NH81 332 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 APH1BQ8WW43 257 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM3CQ92520 227 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM45BQ96B21 275 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 YIPF6Q96EC8 236 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BMFQ96LC9 184 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C4orf45Q96LM5 186 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 Q96MT0 163 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR7D2Q96RA2 312 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 S1PR3Q99500 378 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PINK1Q9BXM7 581 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UCK2Q9BZX2 261 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GAREM1Q9H706 876 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR76Q9H967 626 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ACER3Q9NUN7 267 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLN6Q9NWW5 311 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MUC3AQ02505 3323 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C74A6NCV1 312 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SERINC4A6NH21 518 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BN98 237 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EQM0 130 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R3G1 203 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FFAR1O14842 300 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLPXO76031 633 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EML2O95834 649 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LGI1O95970 557 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV3-19P01714 112 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLPIP03973 132 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS2P07478 247 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IFI6P09912 130 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ADORA3P0DMS8 318 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSEP14091 401 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 POU2F1P14859 743 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RPA2P15927 270 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTM3P21266 225 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR2AP28223 471 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNGR2P38484 337 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC1A3P43003 542 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 XKP51811 444 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C21orf59P57076 290 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R41P59536 307 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SKP1P63208 163 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZXDAP98168 799 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RELAQ04206 551 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FUT5Q11128 374 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ST3GAL3Q11203 375 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 COX10Q12887 443 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ILKQ13418 452 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP6Q13520 282 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms