RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM123Q8N131 208 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR6V1Q8N148 313 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 Q8NA96 180 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SYT14Q8NB59 555 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 NBASA2RRP1 2371 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM183AA6NL82 134 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD4-210ENST00000590061 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD4-210ENST00000590061 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-210ENST00000590061 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.45□□□□□ -1.38
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