RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SAR1AQ9NR31 198 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ARMCX1Q9P291 453 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IL19Q9UHD0 177 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DKKL1Q9UK85 242 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RTTNQ86VV8 2226 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MED12Q93074 2177 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PP18 115 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ANGPT2O15123 496 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA0513O60268 411 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CBR3O75828 277 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KDM4BO94953 1096 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 H6PDO95479 791 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRT75O95678 551 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM107AO95990 144 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NGFRP08138 427 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HPGDP15428 266 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DPP4P27487 766 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DSTNP60981 165 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF117Q03924 483 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 VEZF1Q14119 521 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KEAP1Q14145 624 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SELPLGQ14242 412 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK11Q15759 364 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NPTX1Q15818 432 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK14Q16539 360 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 REP15Q6BDI9 236 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IFNEQ86WN2 208 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PTOV1Q86YD1 416 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RNF128Q8TEB7 428 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM222BQ8WU58 562 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FIG4Q92562 907 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MAL2Q969L2 176 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ROPN1LQ96C74 230 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 EXD2Q9NVH0 621 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 VAPAQ9P0L0 249 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 VDAC3Q9Y277 283 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 WDR45Q9Y484 360 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ANK2Q01484 3957 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PQD3 144 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN24A6NM45 220 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FBP2O00757 339 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HCN1O60741 890 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 WDR1O75083 606 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 STX11O75558 287 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B17O75795 530 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 AK1P00568 194 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FSHBP01225 129 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BCHEP06276 602 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM106CPP0CH98 169 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SRD5A2P31213 254 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 STARP49675 285 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ATP12AP54707 1039 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN15P56746 228 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MTPNP58546 118 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CBX1P83916 185 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HPCAP84074 193 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 EGR4Q05215 589 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RGNQ15493 299 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF141Q15928 474 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RAET1LQ5VY80 246 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CBLN3Q6UW01 205 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GGNQ86UU5 652 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 THAP8Q8NA92 274 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PROX1Q92786 737 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZG16BQ96DA0 208 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms