RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 YIPF5Q969M3 257 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST11Q9NPF2 352 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PNV4 684 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C1C5 153 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 DPP4P27487 766 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGS2P35354 604 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 LCN6P62502 163 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 PCK2Q16822 640 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 TATDN3Q17R31 274 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP69Q49AA0 526 aa22.67■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.67■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf51A8MQB3 221 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A18H0YCH9 400 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A18Q3C1V0 323 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 TOMM5Q8N4H5 51 aa22.65■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 NAP1L6A6NFF2 107 aa22.64■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 GMFGO60234 142 aa22.64■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOVL3Q9HB03 270 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.64■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPA1Q9UND3 350 aa22.64■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPT2A6NK58 231 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53I11O14683 189 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-DQA2P01906 255 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TFPIP10646 304 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CTLA4P16410 223 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RIDAP52758 137 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PCOLCEQ15113 449 aa22.63■■□□□ 1.21
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