RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 CACNA1CQ13936 2221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WUJ7 227 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 ZFAND5O76080 213 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 P04436 131 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 FOSL2P15408 326 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 EPHA1P21709 976 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 INSL4Q14641 139 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 A8MXE2 369 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 OGG1O15527 345 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 FAM3CQ92520 227 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 MMP26Q9NRE1 261 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 GHRLQ9UBU3 117 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 UMAD1C9J7I0 102 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRM-205ENST00000577827 DUSP1P28562 367 aa9.43□□□□□ -0.9
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