RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CDK20	Q8IZL9	346 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF128	Q8TEB7	428 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CT55	Q8WUE5	264 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CYGB	Q8WWM9	190 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C14orf79	Q96F83	325 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SAMD8	Q96LT4	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	GPR173	Q9NS66	373 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	VNN3	Q9NY84	501 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0B4J2E0	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GX12	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	DLGAP1	O14490	977 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	FFAR1	O14842	300 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10H3	O60404	316 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	MPZL2	O60487	215 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	DIRAS1	O95057	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SNAP29	O95721	258 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	LIPC	P11150	499 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PGC	P20142	388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	DLST	P36957	453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PTH2R	P49190	550 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	DAP	P51397	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	IST1	P53990	364 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CSNK2B	P67870	215 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	NNAT	Q16517	81 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	LACC1	Q8IV20	430 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PIGX	Q8TBF5	258 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	DOK4	Q8TEW6	326 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF138	Q8WVD3	245 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZG16B	Q96DA0	208 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RASL10B	Q96S79	203 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PITX2	Q99697	317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	UCK2	Q9BZX2	261 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	LAT2	Q9GZY6	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		Q9H8V8	135 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	BATF3	Q9NR55	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SCN2A	Q99250	2005 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	PIEZO1	Q92508	2521 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		F8VVB4	439 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		F8VWA3	439 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139		M0R3G1	203 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	BCKDK	O14874	412 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	FADS1	O60427	444 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	SERPINA7	P05543	415 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	ADRB1	P08588	477 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	EVI2B	P34910	448 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CNOT1-222	ENST00000570139	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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